Kuid nüüdsed vaktsiinid pole täiuslikud. Kõige hullem on see, et vaktsiinid on valmistatud kogu tapetud viirusest. See tähendab, et analüüsidega ei saa eristada vaktsineeritud ja nakatunud loomi.

Nüüd on teadlased välja töötamas vaktsiini, mis on valmistatud vaid suu- ja sõrataudi viiruse osadest. See tähendab, et lihtsa vereprooviga saab eristada, milline loom on vaktsineeritud ja milline kannab endas haigusviirust.