President Meri sattus suure kriitika alla, kui 26. juulil 1994. aastal allkirjastas Venemaa presidendi Boris Jeltsiniga juulilepped Venemaa vägede lahkumiseks. Kriitika laviini pälvis sõjaväepensionäride sotsiaalsete garantiide kokkuleppe, mis oli üheks tingimuseks Vene vägede lahkumiseks. Kuid eesmärk oli kindlustada Eesti suveräänsus.