Põhilise muudatusena hakkab läbiotsimislube prokuratuuri asemel väljastama kohus. See aga mõjutab otseselt prokuratuuri ja laiemalt kohtusüsteemi töö tõhusust. Kohtute töökoormuse kasvu ja ebapiisava rahastuse tõttu võib näiteks prokuratuuri läbiotsimisloa saamine ja seeläbi kurjategijate tabamine muutuda märksa keerulisemaks.