Muudatused viiakse sisse 63 seadusesse, peamiselt on tegemist maksuameti või tolliameti nimetuse asendamisega uue ameti nimetusega.

Ametite struktuuriüksuste ühendamine toimub neljas etapis kuni aastani 2005. Esimese etapina toimub maksuhaldurite ühinemine ja algab maksuameti struktuurireform, mille tulemusel väheneb ametikohtade arv 157 võrra. Teise etapina viiakse läbi piirkondlike tolliinspektuuride reform seoses Eesti liitumisega Euroopa Liiduga, mille tulemusel väheneb ametikohtade arv 142 ametikoha võrra.

Kolmanda etapina toimub tolliinspektuuride ja piirkondlike maksukeskuste ühinemine ning neljandas etapis viiakse lõpule ühtse maksuhalduri organisatsioonilised ümberkorraldused.